MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 46366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009257	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009257	A	8	8	69	76	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
4	NC_009257	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
5	NC_009257	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
6	NC_009257	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301170
7	NC_009257	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
8	NC_009257	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301170
9	NC_009257	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
10	NC_009257	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
11	NC_009257	T	7	7	327	333	0 %	100 %	0 %	0 %	134301170
12	NC_009257	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301170
13	NC_009257	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
14	NC_009257	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301170
15	NC_009257	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
16	NC_009257	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
17	NC_009257	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
18	NC_009257	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301170
19	NC_009257	AGC	2	6	570	575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301170
20	NC_009257	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301170
21	NC_009257	GCAA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	134301170
22	NC_009257	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
23	NC_009257	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301170
24	NC_009257	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301170
25	NC_009257	TGAT	2	8	815	822	25 %	50 %	25 %	0 %	134301170
26	NC_009257	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
27	NC_009257	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	134301170
28	NC_009257	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134301170
29	NC_009257	GTAC	2	8	1102	1109	25 %	25 %	25 %	25 %	134301170
30	NC_009257	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
31	NC_009257	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301170
32	NC_009257	GCTT	2	8	1198	1205	0 %	50 %	25 %	25 %	134301170
33	NC_009257	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	134301170
34	NC_009257	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301170
35	NC_009257	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301170
36	NC_009257	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301170
37	NC_009257	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301170
38	NC_009257	ATGC	2	8	1429	1436	25 %	25 %	25 %	25 %	134301170
39	NC_009257	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301170
40	NC_009257	TAAA	2	8	1502	1509	75 %	25 %	0 %	0 %	134301170
41	NC_009257	TAAA	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	134301170
42	NC_009257	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	134301171
43	NC_009257	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
44	NC_009257	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
45	NC_009257	AGTT	2	8	1731	1738	25 %	50 %	25 %	0 %	134301171
46	NC_009257	TGAT	2	8	1814	1821	25 %	50 %	25 %	0 %	134301171
47	NC_009257	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
48	NC_009257	AGCA	2	8	1928	1935	50 %	0 %	25 %	25 %	134301171
49	NC_009257	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301171
50	NC_009257	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301171
51	NC_009257	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
52	NC_009257	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301171
53	NC_009257	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301171
54	NC_009257	A	7	7	2151	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	134301171
55	NC_009257	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301171
56	NC_009257	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
57	NC_009257	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
58	NC_009257	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
59	NC_009257	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134301171
60	NC_009257	TCTA	2	8	2572	2579	25 %	50 %	0 %	25 %	134301171
61	NC_009257	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301171
62	NC_009257	GTTT	2	8	2630	2637	0 %	75 %	25 %	0 %	134301171
63	NC_009257	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301171
64	NC_009257	TAA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009257	GAAT	2	8	2706	2713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009257	A	7	7	2725	2731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009257	TA	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009257	AGT	3	9	2779	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009257	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009257	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009257	CAC	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009257	A	6	6	2946	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009257	TGA	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009257	T	6	6	2975	2980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009257	ATA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009257	T	6	6	3043	3048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009257	ACC	2	6	3049	3054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009257	AT	3	6	3068	3073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009257	GAA	2	6	3086	3091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009257	TAT	2	6	3167	3172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301172
81	NC_009257	T	7	7	3188	3194	0 %	100 %	0 %	0 %	134301172
82	NC_009257	ATA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301172
83	NC_009257	TAG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
84	NC_009257	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
85	NC_009257	CAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301172
86	NC_009257	CTT	3	9	3463	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
87	NC_009257	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	134301172
88	NC_009257	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	134301172
89	NC_009257	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	134301172
90	NC_009257	T	7	7	3658	3664	0 %	100 %	0 %	0 %	134301172
91	NC_009257	CTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
92	NC_009257	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
93	NC_009257	GAT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
94	NC_009257	TCAA	2	8	3780	3787	50 %	25 %	0 %	25 %	134301172
95	NC_009257	CAAC	2	8	3819	3826	50 %	0 %	0 %	50 %	134301172
96	NC_009257	AAC	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301172
97	NC_009257	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	134301172
98	NC_009257	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134301172
99	NC_009257	ATTA	2	8	3947	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	134301172
100	NC_009257	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301172
101	NC_009257	TTA	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009257	TA	3	6	4051	4056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009257	CAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009257	TGCT	2	8	4103	4110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009257	A	7	7	4111	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009257	ATG	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009257	CCAT	2	8	4147	4154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009257	AT	3	6	4153	4158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009257	GTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009257	AGT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009257	TAC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009257	AACC	2	8	4237	4244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009257	AAC	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009257	TAAA	2	8	4322	4329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009257	ATC	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009257	CCAA	2	8	4416	4423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009257	GCA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009257	TATT	2	8	4499	4506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009257	TAT	2	6	4520	4525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009257	TAA	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009257	TAG	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009257	TAA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009257	TAAT	2	8	4646	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009257	ATA	2	6	4762	4767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009257	A	8	8	4780	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009257	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301173
127	NC_009257	AGT	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
128	NC_009257	TTG	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301173
129	NC_009257	TGG	3	9	4878	4886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301173
130	NC_009257	CTG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301173
131	NC_009257	ATG	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
132	NC_009257	A	6	6	4999	5004	100 %	0 %	0 %	0 %	134301173
133	NC_009257	GTT	2	6	5026	5031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301173
134	NC_009257	GTA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301173
135	NC_009257	CAA	2	6	5054	5059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301173
136	NC_009257	TTAA	2	8	5178	5185	50 %	50 %	0 %	0 %	134301173
137	NC_009257	AAAG	2	8	5213	5220	75 %	0 %	25 %	0 %	134301174
138	NC_009257	TTG	2	6	5272	5277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134301174
139	NC_009257	TGG	3	9	5291	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134301174
140	NC_009257	ATT	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301174
141	NC_009257	ATA	2	6	5389	5394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301174
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271	NC_009257	ATA	2	6	11050	11055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009257	ACAAA	2	10	11064	11073	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_009257	TAC	2	6	11089	11094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301180
274	NC_009257	T	6	6	11095	11100	0 %	100 %	0 %	0 %	134301180
275	NC_009257	TCA	2	6	11133	11138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301180
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280	NC_009257	T	6	6	11255	11260	0 %	100 %	0 %	0 %	134301180
281	NC_009257	AT	4	8	11281	11288	50 %	50 %	0 %	0 %	134301180
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288	NC_009257	AT	3	6	11574	11579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009257	CAA	2	6	11594	11599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_009257	AT	3	6	11715	11720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009257	CGA	2	6	11759	11764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_009257	T	6	6	11883	11888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009257	TTG	2	6	11897	11902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_009257	GCT	2	6	12128	12133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_009257	GCT	2	6	12147	12152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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